Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms