Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC9B1Q4ZJI4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9B1Q4ZJI4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9B1Q4ZJI4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9B1Q4ZJI4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9B1Q4ZJI4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9B1Q4ZJI4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9B1Q4ZJI4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms