Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYTL3Q4VX76 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL3Q4VX76 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL3Q4VX76 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL3Q4VX76 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL3Q4VX76 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL3Q4VX76 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL3Q4VX76 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL3Q4VX76 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL3Q4VX76 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL3Q4VX76 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL3Q4VX76 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL3Q4VX76 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL3Q4VX76 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL3Q4VX76 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL3Q4VX76 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL3Q4VX76 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL3Q4VX76 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms