Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TPRNQ4KMQ1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
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