Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01559Q495D7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01559Q495D7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms