Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms