Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MSMPQ1L6U9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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