Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNOP1Q1ED39 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms