Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC142Q17RM4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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