Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDR2Q16832 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDR2Q16832 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDR2Q16832 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDR2Q16832 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDR2Q16832 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDR2Q16832 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDR2Q16832 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR2Q16832 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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