Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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