Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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LY6EQ16553 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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LY6EQ16553 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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LY6EQ16553 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LY6EQ16553 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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