Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA6Q16445 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA6Q16445 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms