Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA4Q16363 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
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