Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZIC1Q15915 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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ZIC1Q15915 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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