Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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VAMP3Q15836 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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VAMP3Q15836 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VAMP3Q15836 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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