Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NPTX1Q15818 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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