Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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HERC1Q15751 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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HERC1Q15751 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
HERC1Q15751 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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