Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM1Q15629 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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