Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRADDQ15628 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms