Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX1Q15475 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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