Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NECTIN1Q15223 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
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