Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARHGEF6Q15052 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGEF6Q15052 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms