Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCAPD2Q15021 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCAPD2Q15021 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
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