Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF3Q14653 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms