Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SQLEQ14534 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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