Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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CKAP5Q14008 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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CKAP5Q14008 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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