Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PKP1Q13835 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms