Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA9Q13797 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms