Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
APOFQ13790 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOFQ13790 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOFQ13790 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOFQ13790 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOFQ13790 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOFQ13790 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOFQ13790 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOFQ13790 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOFQ13790 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOFQ13790 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOFQ13790 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOFQ13790 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOFQ13790 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOFQ13790 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOFQ13790 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOFQ13790 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOFQ13790 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOFQ13790 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APOFQ13790 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOFQ13790 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOFQ13790 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOFQ13790 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOFQ13790 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOFQ13790 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOFQ13790 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOFQ13790 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOFQ13790 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOFQ13790 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOFQ13790 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOFQ13790 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOFQ13790 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOFQ13790 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOFQ13790 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOFQ13790 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOFQ13790 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOFQ13790 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOFQ13790 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOFQ13790 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOFQ13790 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOFQ13790 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOFQ13790 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOFQ13790 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APOFQ13790 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APOFQ13790 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOFQ13790 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOFQ13790 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOFQ13790 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOFQ13790 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOFQ13790 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOFQ13790 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
APOFQ13790 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOFQ13790 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOFQ13790 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOFQ13790 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOFQ13790 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOFQ13790 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOFQ13790 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOFQ13790 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOFQ13790 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOFQ13790 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOFQ13790 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOFQ13790 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOFQ13790 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOFQ13790 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOFQ13790 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
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APOFQ13790 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOFQ13790 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
APOFQ13790 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOFQ13790 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOFQ13790 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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APOFQ13790 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOFQ13790 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
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APOFQ13790 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
APOFQ13790 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
APOFQ13790 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOFQ13790 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOFQ13790 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOFQ13790 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOFQ13790 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOFQ13790 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOFQ13790 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOFQ13790 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOFQ13790 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOFQ13790 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOFQ13790 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOFQ13790 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOFQ13790 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOFQ13790 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOFQ13790 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOFQ13790 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOFQ13790 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOFQ13790 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APOFQ13790 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APOFQ13790 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APOFQ13790 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
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