Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC2Q13753 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms