Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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TUBA3CQ13748 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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TUBA3CQ13748 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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TUBA3CQ13748 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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TUBA3CQ13748 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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TUBA3CQ13748 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBA3CQ13748 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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