Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH18Q13634 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CDH18Q13634 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH18Q13634 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CDH18Q13634 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH18Q13634 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH18Q13634 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH18Q13634 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH18Q13634 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH18Q13634 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH18Q13634 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH18Q13634 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH18Q13634 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH18Q13634 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH18Q13634 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH18Q13634 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH18Q13634 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH18Q13634 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH18Q13634 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH18Q13634 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH18Q13634 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH18Q13634 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH18Q13634 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH18Q13634 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH18Q13634 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDH18Q13634 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH18Q13634 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDH18Q13634 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH18Q13634 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH18Q13634 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH18Q13634 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH18Q13634 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH18Q13634 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH18Q13634 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH18Q13634 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH18Q13634 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH18Q13634 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH18Q13634 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH18Q13634 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH18Q13634 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH18Q13634 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH18Q13634 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH18Q13634 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH18Q13634 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH18Q13634 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH18Q13634 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH18Q13634 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH18Q13634 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH18Q13634 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH18Q13634 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH18Q13634 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH18Q13634 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH18Q13634 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH18Q13634 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH18Q13634 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH18Q13634 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH18Q13634 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDH18Q13634 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH18Q13634 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH18Q13634 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH18Q13634 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH18Q13634 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH18Q13634 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDH18Q13634 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH18Q13634 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH18Q13634 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH18Q13634 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH18Q13634 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH18Q13634 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH18Q13634 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH18Q13634 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH18Q13634 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH18Q13634 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH18Q13634 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH18Q13634 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDH18Q13634 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH18Q13634 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDH18Q13634 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH18Q13634 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH18Q13634 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH18Q13634 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
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