Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL3Q13618 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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