Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 RAB17-206ENST00000414278 1511 ntTSL 214.77□□□□□ -0.042e-8■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 EEF1D-251ENST00000534232 817 ntTSL 514.74□□□□□ -0.051e-6■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 G3BP2-205ENST00000502654 546 ntTSL 414.69□□□□□ -0.062e-8■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 EEF1D-252ENST00000534377 617 ntTSL 214.65□□□□□ -0.061e-6■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 RAB17-202ENST00000392001 1792 ntTSL 1 (best)14.62□□□□□ -0.072e-8■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 EEF1D-245ENST00000532596 761 ntTSL 414.57□□□□□ -0.081e-6■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.151e-6■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.191e-6■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 EEF1D-247ENST00000533204 842 ntTSL 213.55□□□□□ -0.241e-6■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 EEF1D-236ENST00000531218 787 ntTSL 313.33□□□□□ -0.281e-6■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 EEF1D-253ENST00000534380 1001 ntTSL 513.33□□□□□ -0.281e-6■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 EEF1D-215ENST00000526340 770 ntTSL 313.31□□□□□ -0.281e-6■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.281e-6■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 EEF1D-248ENST00000533494 758 ntTSL 512.48□□□□□ -0.411e-6■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 RAB17-210ENST00000477149 3211 ntTSL 1 (best)11.95□□□□□ -0.52e-8■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 MALRD1-202ENST00000377266 4461 ntTSL 59.21□□□□□ -0.931e-6■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 EEF1D-226ENST00000529516 473 ntTSL 39.04□□□□□ -0.961e-6■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 MALRD1-201ENST00000377265 1761 ntTSL 26.61□□□□□ -1.351e-6■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.516e-7■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 HELZ-206ENST00000579953 6365 ntTSL 25.54□□□□□ -1.526e-7■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.731e-6■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.811e-6■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 MALRD1-205ENST00000480707 414 ntTSL 33.54□□□□□ -1.841e-6■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.96e-7■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 CIZ1-202ENST00000324544 809 ntTSL 310.97□□□□□ -0.653e-9■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 EHBP1-204ENST00000405482 1311 ntTSL 222.19■■□□□ 1.142e-7■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 EHBP1-211ENST00000449820 539 ntTSL 58.72□□□□□ -1.012e-7■■□□□ 11.9
TRA2AQ13595 PRRC2C-211ENST00000495585 5566 ntTSL 1 (best)4.38□□□□□ -1.712e-7■■□□□ 11.8
TRA2AQ13595 CNOT1-208ENST00000565697 385 ntTSL 39.76□□□□□ -0.859e-9■■□□□ 11.8
TRA2AQ13595 YTHDC1-206ENST00000510746 515 ntTSL 423.69■■□□□ 1.382e-12■■□□□ 11.8
TRA2AQ13595 CANX-207ENST00000503303 345 ntTSL 57.91□□□□□ -1.142e-19■■□□□ 11.8
TRA2AQ13595 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.432e-11■■□□□ 11.8
TRA2AQ13595 MTF2-214ENST00000545708 4046 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.072e-11■■□□□ 11.8
TRA2AQ13595 MTF2-213ENST00000540243 3845 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.122e-11■■□□□ 11.8
TRA2AQ13595 MTF2-201ENST00000370298 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.132e-11■■□□□ 11.8
TRA2AQ13595 MTF2-205ENST00000471953 1937 ntTSL 26.03□□□□□ -1.442e-11■■□□□ 11.8
TRA2AQ13595 MTF2-203ENST00000467953 1870 ntTSL 1 (best)5.6□□□□□ -1.512e-11■■□□□ 11.8
TRA2AQ13595 MTF2-210ENST00000489480 1381 ntTSL 1 (best)4.32□□□□□ -1.722e-11■■□□□ 11.8
TRA2AQ13595 MTF2-208ENST00000476037 788 ntTSL 54.03□□□□□ -1.762e-11■■□□□ 11.8
TRA2AQ13595 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.021e-7■■□□□ 11.8
TRA2AQ13595 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.391e-7■■□□□ 11.8
TRA2AQ13595 ACIN1-213ENST00000555053 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.591e-7■■□□□ 11.8
TRA2AQ13595 ACIN1-223ENST00000605057 4474 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.81e-7■■□□□ 11.8
TRA2AQ13595 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.778e-12■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 MED15-222ENST00000473244 2733 ntTSL 1 (best)16.25■□□□□ 0.191e-8■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 MED15-231ENST00000493216 4701 ntTSL 215.53■□□□□ 0.081e-8■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.311e-8■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.381e-8■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.411e-8■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 MED15-223ENST00000476187 593 ntTSL 412.29□□□□□ -0.441e-8■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 MED15-211ENST00000433831 3267 ntTSL 511.85□□□□□ -0.511e-8■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.61e-8■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 MED15-229ENST00000489651 3563 ntTSL 1 (best)9.9□□□□□ -0.821e-8■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 MED15-230ENST00000492381 3619 ntTSL 29.01□□□□□ -0.971e-8■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 CCNL2-216ENST00000488340 1598 ntTSL 220.98■□□□□ 0.951e-7■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.341e-7■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 CCNL2-213ENST00000481223 2815 ntTSL 216.17■□□□□ 0.181e-7■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 CCNL2-215ENST00000482621 2059 ntTSL 214.46□□□□□ -0.091e-7■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 CCNL2-218ENST00000496007 4452 ntTSL 211.5□□□□□ -0.571e-7■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.276e-7■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 HMG20B-201ENST00000262949 886 ntTSL 522.93■■□□□ 1.266e-7■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 HMG20B-205ENST00000435022 616 ntTSL 522.11■■□□□ 1.136e-7■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 HMG20B-203ENST00000416526 711 ntTSL 321.52■■□□□ 1.046e-7■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 HMG20B-212ENST00000487894 1242 ntTSL 216.68■□□□□ 0.266e-7■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 HMG20B-213ENST00000488973 2434 ntTSL 1 (best)16.66■□□□□ 0.266e-7■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 HMG20B-210ENST00000483417 580 ntTSL 39.37□□□□□ -0.916e-7■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.338e-10■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.478e-10■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 XRCC6-203ENST00000402580 2006 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.818e-10■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 XRCC6-206ENST00000428575 2148 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.838e-10■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 XRCC6-204ENST00000405506 1958 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.98e-10■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 XRCC6-205ENST00000405878 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.978e-10■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 XRCC6-207ENST00000464116 359 ntTSL 27.98□□□□□ -1.138e-10■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 SSRP1-202ENST00000293880 6296 ntTSL 213.97□□□□□ -0.178e-7■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 FNBP4-202ENST00000524696 481 ntTSL 311.98□□□□□ -0.494e-9■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 AP3B1-203ENST00000517940 974 ntTSL 211.35□□□□□ -0.594e-9■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 SSRP1-201ENST00000278412 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.698e-7■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 AP3B1-201ENST00000255194 5838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.984e-9■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.574e-9■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 CDK5RAP2-215ENST00000482047 565 ntTSL 44.67□□□□□ -1.664e-6■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 FNBP4-207ENST00000528388 814 ntTSL 23.86□□□□□ -1.794e-9■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 AP3B1-205ENST00000519888 519 ntTSL 52.92□□□□□ -1.944e-9■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 ULK1-204ENST00000540647 1211 ntTSL 219.52■□□□□ 0.727e-6■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 FAM193B-211ENST00000508298 479 ntTSL 518.51■□□□□ 0.557e-6■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.437e-6■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.427e-6■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 FAM193B-210ENST00000507587 825 ntTSL 217.6■□□□□ 0.417e-6■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.067e-6■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 SNHG22-202ENST00000615535 421 nt15.28■□□□□ 0.047e-6■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 ULK1-205ENST00000541761 1262 ntTSL 215.11■□□□□ 0.017e-6■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 ERICH1-204ENST00000518895 585 ntTSL 315.03■□□□□ -07e-6■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 FAM193B-208ENST00000506955 4604 ntTSL 1 (best)14.69□□□□□ -0.067e-6■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.277e-6■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 GIGYF2-215ENST00000427649 677 ntTSL 512□□□□□ -0.497e-6■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 GIGYF2-221ENST00000445650 588 ntTSL 311.85□□□□□ -0.517e-6■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 GIGYF2-219ENST00000436349 547 ntTSL 411.15□□□□□ -0.627e-6■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 GIGYF2-208ENST00000421778 564 ntTSL 410.56□□□□□ -0.727e-6■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 GIGYF2-211ENST00000424414 583 ntTSL 49.82□□□□□ -0.847e-6■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 GIGYF2-222ENST00000455139 556 ntTSL 59.06□□□□□ -0.967e-6■■□□□ 11.7
TRA2AQ13595 LARS-202ENST00000394434 4766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.077e-6■■□□□ 11.7
Retrieved 100 of 7,337 protein–RNA pairs in 87.1 ms