Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
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