Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMAD4Q13485 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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