Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE3BQ13370 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE3BQ13370 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
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