Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
KLF1Q13351 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF1Q13351 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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