Protein–RNA interactions for Protein: Q13206

DDX10, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX10Q13206 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX10Q13206 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX10Q13206 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX10Q13206 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX10Q13206 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX10Q13206 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX10Q13206 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
DDX10Q13206 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DDX10Q13206 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DDX10Q13206 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX10Q13206 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms