Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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