Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLFQ13129 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLFQ13129 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLFQ13129 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLFQ13129 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLFQ13129 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLFQ13129 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLFQ13129 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLFQ13129 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLFQ13129 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLFQ13129 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLFQ13129 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLFQ13129 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLFQ13129 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RLFQ13129 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RLFQ13129 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RLFQ13129 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RLFQ13129 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RLFQ13129 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RLFQ13129 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RLFQ13129 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLFQ13129 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLFQ13129 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RLFQ13129 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLFQ13129 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLFQ13129 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLFQ13129 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLFQ13129 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RLFQ13129 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLFQ13129 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLFQ13129 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLFQ13129 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLFQ13129 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLFQ13129 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLFQ13129 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLFQ13129 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLFQ13129 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLFQ13129 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLFQ13129 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLFQ13129 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RLFQ13129 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RLFQ13129 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RLFQ13129 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RLFQ13129 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RLFQ13129 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RLFQ13129 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RLFQ13129 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
RLFQ13129 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RLFQ13129 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RLFQ13129 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
RLFQ13129 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RLFQ13129 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RLFQ13129 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLFQ13129 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLFQ13129 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLFQ13129 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLFQ13129 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLFQ13129 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLFQ13129 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLFQ13129 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLFQ13129 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLFQ13129 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLFQ13129 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLFQ13129 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLFQ13129 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLFQ13129 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLFQ13129 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLFQ13129 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RLFQ13129 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RLFQ13129 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLFQ13129 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RLFQ13129 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RLFQ13129 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLFQ13129 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLFQ13129 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLFQ13129 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLFQ13129 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLFQ13129 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLFQ13129 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLFQ13129 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLFQ13129 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLFQ13129 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RLFQ13129 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLFQ13129 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RLFQ13129 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLFQ13129 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLFQ13129 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLFQ13129 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RLFQ13129 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLFQ13129 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLFQ13129 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLFQ13129 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLFQ13129 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLFQ13129 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLFQ13129 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLFQ13129 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLFQ13129 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLFQ13129 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLFQ13129 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLFQ13129 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms