Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFIAQ12857 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIAQ12857 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
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