Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPTFQ12830 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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