Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFEMP1Q12805 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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