Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SREBF2Q12772 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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