Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC173Q0VFZ6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms