Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C2orf54Q08AI8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms