Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLFN5Q08AF3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms