Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4CQ08493 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms